Po zasiedleniu przez bakterię górnych dróg oddechowych, dojść może do kilku różnych, ciężkich zakażeń pneumokokowych, zwanych ze względu na znaczne nasilenie i obejmowanie ważnych narządów wewnętrznych zakażeniami inwazyjnymi. W przebiegu takiego zakażenia pneumokoki znajdują się we krwi lub innym miejscu w organizmie człowieka, w którym nie powinno ich być.
• Do najczęstszych zakażeń inwazyjnych należą:
- zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych
- bakteriemia (bakteryjne zakażenie krwi, bez wyraźnych objawów chorobowych)
- posocznica, inaczej sepsa (bakteryjne zakażenie krwi z występującymi objawami uogólnionego zakażenia objawami ze strony różnych narządów)
- zapalenie płuc
• Rzadziej występujące inwazyjne zakażenia, które mogą być spowodowane przez pneumokoki:
- zapalenie wyrostka robaczkowego, kości i szpiku, stawów, woreczka żółciowego, wsierdzia, osierdzia, jądra, najądrza, ślinianek, prostaty, pochwy, szyjki macicy, jajowodu, otrzewnej
• Pneumokoki mogą wywoływać również mniej poważne choroby nieinwazyjne, ale za to bardzo często występujące:
- zapalenie ucha środkowego
- zapalenie zatok przynosowych
- zapalenie spojówek
